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新型冠状病毒肺炎后肺间质纤维化与口咽部菌群失衡的相关性
作者:陈玉 周欣佑 蔡昀朴 章从恩 聂秀红 
单位:100053 北京 首都医科大学宣武医院呼吸与危重症医学科 100069 北京 首都医科大学 100050   首都医科大学附属北京友谊医院药学部 
关键词:肺间质纤维化 新型冠状病毒 口咽微生物组 菌群失衡 16S rRNA基因测序 
分类号:
出版年,卷(期):页码:2026,20(3):129-138
摘要:
目的 探索口咽部菌群失衡在新型冠状病毒肺炎后肺间质纤维化(PCPF)发生与发展中的作用及潜在机制。方法 采用横断面病例对照研究,选择2022年12月至2023年5月因新型冠状病毒肺炎(COVID-19)于首都医科大学宣武医院住院治疗并完成出院后2年随访的康复患者为研究对象。根据随访时高分辨率计算机断层扫描影像学表现,将患者分为纤维化组和非纤维化组。Mann-Whitney U检验比较两组患者口咽部微生物菌群α多样性;采用非度量多维尺度分析(NMDS)与主坐标分析(PCoA)评估两组菌群β多样性;以Benjamini-Hochberg法进行FDR校正分析门、属、种的丰度差异,并采用Spearman秩相关分析其与临床症状及运动耐量间的相关性。结果 共纳入83例患者,其中纤维化组43例,非纤维化组40例。随访2年时,纤维化组患者出现更多的呼吸道症状,mMRC评分(U = 676.0、P = 0.008)、BCSS评分(U = 625.0、P = 0.029)、CAT评分(t = 2.127、P = 0.036)和CET评分(U = 538.5、P = 0.002)均显著高于非纤维化组,但6 min步行距离(6MWD)更短(U = 598.5、P = 0.017)。微生物组分析显示,纤维化组患者口咽微生物α多样性显著升高(Chao1
指数:U = 580.5、P = 0.010;Shannon指数:U = 557.0、P = 0.005;Simpson指数:U = 513.0、P = 0.001;Faith系统发育多样性指数:U = 579.0、P = 0.010;Simpson e指数:U = 577.0、P = 0.010;Heip e均匀度指数:U = 529.0、P = 0.035)。β多样性分析显示两组患者菌群结构明显分离。菌群分类学分析显示,纤维化组患者普雷沃菌属(U = 358.0、P < 0.001)、韦荣菌属(U = 418.0、P < 0.001)及链球菌属(U = 538.0、P = 0.003)等潜在促炎性菌群相对丰度较非纤维化组患者显著增加,而奈瑟菌属(U = 226.0、P < 0.001)显著减少。部分差异显著菌种如Streptococcusparasanguinis丰度与mMRC评分(r = 0.24、P = 0.04)和CAT评分(r = 0.27、P = 0.02)呈正相关;Fusobacterium_C_periodonticum_D的丰度与CAT评分(r =-0.30、P < 0.001)和Warrick评分(r = -0.26、P = 0.02)均呈负相关,而与6MWD(r = 0.26、P = 0.02)呈正相关;Veillonella A rogosae及Streptococcus infantis均与Warrick评分呈负相关(r =-0.30、P < 0.01,r =-0.28、P = 0.01),均具有统计学意义。结论 PCPF患者存在持续的口咽部菌群失衡,其特征与临床症状及功能受损密切相关。口咽微生物可能成为PCPF风险评估的潜在非侵入性生物标志物及新型治疗靶点。
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